Seltene Fälle von Magen- oder Darm-Unverträglichkeit, wie Übelkeit, Diarrhöe, Magenschmerzen und Kopfschmerzen, sind beschrieben worden. Diese Nebenwirkungen lassen sich durch Reduktion der Dosierung beheben. Vereinzelte Fälle allergischer Reaktionen (Pruritus, Urtikaria, Exanthem) wurden gemeldet. Bei Patienten mit Hypersensibilität gegenüber Carbocistein kann das Arzneimittel eine Stomatitis oder Rhinitis auslösen.
