Des effets secondaires tels qu'anorexie, nausées, myalgies, arthralgies, maux de tête et stupeur peuvent se présenter. Des troubles du rythme cardiaque peuvent survenir lors d'un traitement par de l'édétate calcique disodique. L'injection intraveineuse de solutions concentrées d'édétate calcique disodique (>0,5%) peut conduire à des thromboses veineuses.
