Pharmacocinétique

A cause de ses propriétés cationiques la chlorhéxidine se lie fortement à la peau, aux muqueuses et autres tissus et l’absorption par voie systémique est minime. Sur la peau intacte l’absorption transcutanée est négligeable. Par l’application sur la peau endommagée des taux sériques mesurables peuvent être atténues; mais aucun effet indésirable causé par l’absorption cutanée n’a été rapporté.
La chlorhéxidine n’est presque pas absorbé par le tractus gastro-intestinal et elle est éliminée principalement par les fèces.